Oui les deux sont possibles.
Cependant, « préposition + lequel » permet une précision, ici sans doute inutile.
Ces exemples le montrent :
Le secrétaire où se trouvait le document a été renversé.
Le secrétaire sur lequel  se trouvait le document a été renversé.
Le secrétaire dans lequel se trouvait le document a été renversé.

Pour votre phrase, je choisirais « où » , plus léger, puisqu’il n’est pas besoin de plus de précision.

1.Les enfants sont malheureux.
2.Les parents de ces enfants les maltraitent

Pour aboutir à : Les enfants que les parents maltraitent sont malheureux,  votre phrase 2 devrait être : les parents maltraitent ces enfants.
Votre phrase 2 est déjà transformée  :  un pronom reprend le mot enfant.

Pour faire une subordination je  partirai donc de ces deux phrases :
1. les enfants sont malheureux.
2. Les(ces) parents maltraitent les (ces) enfants.
Le seul nom qui se retrouve dans ces deux phrases  est « enfants » : on pourra donc avoir :
Les enfants que les parents maltraitent sont malheureux.
ou :
Les enfants qui sont maltraités par leurs parents sont malheureux.( où on procède en plus à une transformation passive qui rend l’objet « enfants », sujet et l’agent « parents » complément).
Seul le mot « enfants » peut être repris par un pronom relatif, le mot « parents » n’apparaissant qu’une fois (dans la première phrase).

Bonjour Guillaume.
Vous pouvez consulter ce site :

Comment écrire les chiffres : les règles typographiques | Blog Librinova

Dans ces cas, la virgule correspond à une pause, peut-être même très légère, et de toutes façons à une courbe de l’intonation (sur l’incise)  orales. Vous ne changerez donc rien « à l’oreille » en enlevant la virgule.
Je le répète, si vous ne voulez pas de cette incise, écrivez la phrase autrement.

Je me permets de vous renvoyer, Poppy, à la réponse très complète de Tony à une autre question du même genre :
Un justificatif de paiement et des justificatifs de paiement(S) | Question Orthographe Voltaire

Rodsulli, il me semble vous avoir répondu quelque part que la virgule, si elle est dans certains cas obligatoire ou bien encore nécessaire au sens, est parfois facultative et utilisée ou non pour créer un rythme ou une insistance.
On ne peut ici vous donner une réponse pour chacune des phrases que vous inventez. A vous de vous reporter à ce qu’on vous a déjà dit et à vous encore de faire des choix.

Oui, les guillemets servent, dans cette phrase à montrer que le mot est cité pour lui- même.

Chaque premier samedi du mois, on y trouve presque tout; et, même en semaine, les marchands sont nombreux.

Le point virgule me semble bien utilisé ici Rodsulli. Les deux propositions indépendantes qu’il sépare ont entre elles, une relation logique, mais assez faible. Il est bien dans son emploi.

Pour ce qui est de la première phrase, elle est très longue et le point virgule donne un rythme à l’énumération en soulignant le dernier élément. Je le trouve bien venu aussi.

On dit : la tendance est à + infinitif
La tendance est aujourd’hui à écouter l’enfant.
Ou
La tendance est à + nom
La tendance de la mode est cet été aux tissus à pois.

Je ne sais pas ce que sont « les comptes de recrutement » (je ne mettrais pas recrutement au pluriel s’il est considéré  avec un sens global); je vous propose cependant :
La tendance est aux comptes de recrutement
ou, si vous voulez être plus précis utilisez la structure : la tendance est à + infinitif  + les comptes de recrutement.
(je ne peux vous proposer de verbe car je ne connais pas ce domaine).

Il faut encadrer les incises de virgules. Les enlever ne changera rien, il y aura toujours une « suspension syntaxique » après le « que ».
Si vous voulez éviter cela il faut réécrire la phrase :
« Il acquit bientôt la certitude que, dans un rayon de cent mètres, aucun oiseau ne pourrait échapper à son tir. »
Par exemple :
Il acquit bientôt la certitude qu’aucun oiseau ne pourrait échapper à son tir dans un rayon de cent mètres.
Aucun oiseau ne pourrait échapper à son tir dans un rayon de cent mètres, il en eut bientôt la certitude.