Dans le premier cas effectivement, « auraient dû » ne convient pas puisque l’évènement peut se produire, donc je pensais à conserver le conditionnel dans cette transposition de la phrase au passé.

Dans le second cas c’est bien un futur : le narrateur s’autorisera au cas où ; et j’hésite entre futur antérieur et conditionnel pour transposer au passé.

Enfin, « aurait émergé » suggère aussi que ça n’a pas été le cas. Du coup, je pense à conserver le conditionnel initial là aussi.