Pour écrire « dont », il faut pouvoir écrire « de ». Ex : – dont je suis amoureux –> de qui je suis amoureux ; je suis amoureux de qui ?
– dont nous parlons –> duquel ou de qui nous parlons ; nous parlons de quoi, de qui ?

Ici, il faut écrire « que », pronom relatif mis pour « pièces justificatives », complément d’objet direct du verbe « trouver ».  Vous trouverez quoi ? –> que, c’est-à-dire deux pièces jointes.

J’écrirais : « J’ai rajouté 2 pièces justificatives que vous trouverez en pièces jointes. »
ou tout simplement « J’ai rajouté 2 pièces justificatives en pièces jointes. » ou « Je joins deux pièces justificatives supplémentaires »… pour éviter de répéter le mot « pièces ».

Cdlt