Bonjour,

Avoir un bon fond, c’est avoir une personnalité morale , une bonté et une honnêteté foncière.
Cette expression du siècle dernier a rapidement pris une valeur prudhommesque*, mise en valeur par M. Proust dans la séquence de lieux communs moraux qui caractérise un personnage.

On sent qu’elle a un bon fond, c’est une fille qui n’est pas commune, elle doit être la fille de gens bien, elle est certainement restée toujours dans le droit chemin. (M. Proust :  la recherche du temps perdu)

* Se dit, par dérision, d’une personne qui prend un air important pour se répandre en platitudes et en banalités.
 Par métonymie.
 Un discours d’une emphase prudhommesque.

Ref : Dictionnaire des expressions et locutions figurées.

Fonds se dit des biens appartenant à une personne physique ou morale.

Au figuré se dit de ce qu’une personne possède en propre,  en fait de qualités, de ressources intellectuelles ou morales. 

Ce vieillard ingambe a un excellent fonds de santé.
Pierre a un grand fonds d’érudition.

À noter que dans ce cas on peut aussi écrire fond.

La curiosité d’esprit fait le fond de sa nature.
Cet acte révèle le fond de son caractère. 

Le nom commun « fonds » qui prend un S au singulier désigne un support de valeurs : un fonds commun de placement, un fonds de commerce ou encore un fonds de musée ou de bibliothèque.
Le fond de la piscine ou le « bon fond » ne prennent pas de S au singulier.