A1. Personne ne savait à quelle heure elle rentrait, si elle mangeait ou si elle repartait …
A2. Personne ne sait à quelle heure elle rentre, si elle mange ou si elle repart …

B1. Personne ne savait à quelle heure elle rentrait, si elle mangerait ou si elle repartirait …
B2. Personne ne sait à quelle heure elle rentre, si elle mangera ou si elle repartira…

Les phrases A1 et B1 sont au passé. A2 et B2 sont au présent.
Diriez-vous que les phrases A2 et B2 ont exactement le même sens ?
Il est vrai que parfois le présent peut avoir une valeur de futur, mais on fait justement ce choix, d’exprimer un futur avec un présent.
Et d’ailleurs, en A2, « mange » et « repart » n’ont sûrement pas cette valeur (puisque vous ne faites pas varier le verbe rentrer lorsque vous proposez B).
Choisissez selon ce que vous voulez dire. Ou bien, si vous avez besoin d’aide pour cela, donnez-nous plus de contexte.

Virginie,
Vos deux tournures peuvent être correctes, et le sens est le même.

Malgré tout, il vaut mieux employer « ni » à la place de « ou« , et je vous suggère le conditionnel aussi pour le verbe « rentrer ».
Mes suggestions :
Personne ne savait à quelle heure elle rentrait, si elle (restait manger) mangeait, ni si elle (repartait) partait une nouvelle fois…

Personne ne savait à quelle heure elle rentrerait, si elle (resterait manger) mangerait, ni si elle (repartirait) partirait une nouvelle fois…