Généralement, on réalise un chiffre d’affaires avec plusieurs affaires. Donc, un modèle d’affaires obéit à la même logique.

Dans l’article wikipédia il est écrit : 
Les modèles d’affaires associés sont la vente de licences d’utilisation, la sous-traitance et la maintenance, sur place ou à distance.

Donc, affaire n’a pas ici  le sens de entreprise mais de « mode de gestion », donc on peut garder le « s » : 
un modèle d’affaires est un modèle de gestion, c’est la traduction française de « business model » qui signifie « mode de gestion ou d’exploitation ».

Bonjour,

Affaire a ici le sens d’entreprise industrielle ou commerciale.

On dira :

M. Durant dirige une affaire de transport.

«Les modèles d’affaires des entreprises» est pléonastique.