En effet ces phrases sont correctes.

Quand on a le choix entre différents modes, ici l’indicatif, le conditionnel et le subjonctif, les sens ou l’intention du destinateur varient évidemment. Il semble s’agir à chaque fois de nuances mais l’auteur des phrases choisit instinctivement celle qui correspond à sa pensée exacte :

Êtes-vous sûr qu’il écrivait tous ses romans selon le même schéma ?
La question porte sur le doute du destinataire concernant le même schéma et pas sur le fait que « il » écrivait. Le verbe « écrire » est donc au temps du réel : l’indicatif.

Êtes-vous sûr qu’il écrirait un article favorable sur notre initiative ?
La question porte sur l’éventualité (probable) de l’acte d’écrire : le conditionnel marque cette éventualité : cette fois-ci  « écrire » n’est pas un fait avéré.

Êtes-vous sûr qu’il écrive ses romans d’un trait ?
Le focus se déplace sur « êtes-vous sûr » qui est l’intention de la demande, c’est à dire sur l’attitude mentale du destinataire. L’écriture des romans d’un trait n’est présenté cette fois que comme l’objet de cette attitude mentale.

Un grand merci pour vos explications !