« En fonction de » est une locution prépositionnelle,  au même titre par exemple que « au-dessus de« , et je ne vois pas comment elle pourrait introduire directement une proposition subordonnée interrogative. En tout cas il serait plus élégant de dire « en fonction de l’existence d’une desserte par le train« .
« Selon si »  est une formule qui grince à mes oreilles alors que « Selon que » peut très bien convenir  (Selon que vous serez puissant ou misérable… La Fontaine)

Bonjour
1. Je choisis mes activités selon / suivant qu’il y a un train ou non ou en fonction de la présence ou non d’une ligne ferroviaire
2. Ça peut être un paronyme ou un homonyme selon / suivant la façon dont vous le prononcez ou selon / suivant / en fonction de votre prononciation.
3. Il y a deux façons d’analyser cet évènement selon / suivant que tu es pour ou contre la réforme ou en fonction de ta position vis à vis de la réforme.

– En fonction de (locution prépositive) + nom  ou pronom>>  En fonction de l‘heure à laquelle le train arrive…

– Suivant (préposition) + nom ou pronom >> suivant la prononciation que vous adoptez

– Suivant que -(locution conjonctive) + proposition subordonnée >> suivant qu‘on  prononce la finale  {e] ou [ɛ]

– Selon (préposition) + nom ou pronom >> selon ton opinion concernant la réforme

– Selon que (locution conjonctive) + proposition subordonnée >> selon que tu sois pour ou contre la réforme

Il est impossible de placer une conjonction de subordination après une préposition ou une locution prépositive
en fonction de si, suivant comment, selon si sont faux.