Je l’informais que je pourraiS être dans ses bureaux moins d’une heure plus tard.
Dans cette phrase, vous avez un conditionnel présent qui indique non une hypothèse mais un futur (eh oui) par rapport au passé « je l’informais ».
Donc tout est bien, c’est le futur du passé. Voilà la règle : pour exprimer le futur par rapport à un repère passé, on utilise le conditionnel présent.
Celui-ci perd sa valeur modale et acquiert une valeur temporelle.
Retenez : 
Aujourd’hui, il me dit que (plus tard) il fera.
Hier, il m’a dit que (plus tard) il ferait.

– concernant l’utilisation de l’imparfait pour je l’informais alors que le premier verbe est au passé simple
Il est très fréquent justement qu’un auteur (un bon auteur) joue ainsi avec les temps et même avec la chronologie. Et même avec l’écoulement du temps. C’est ainsi qu’il sculpte son récit, lui donne du relief.
Je m’explique :
Le passé simple et l’imparfait ont des aspects différents.
Le PS montre l’action dans sa globalité. on l’utilise quand on veut faire avancer le récit : succession d’actions, de faits, d’événements. Avec « il m’indiqua » on est dans ce processus.
L’imparfait présente l’action dans (à l‘intérieur) de son déroulement. Il permet une pause dans le récit, ou tout au moins le ralentit. C’est le temps privilégié pour la description, les informations données… ici je l’informais a stoppé l’énumération des actions, il indique au lecteur que le temps va être autre, que le récit ralentit, qu’on va donner plus de détails.
La suite du récit devrait le montrer. Si ce n’est pas le cas, en effet, cet imparfait est à peu près inutile.

– quant à je pourrais : c’est un futur. Un futur du passé.
Ce n’est que quand ce futur du passé a été utilisé pour une valeur modale qu’il est devenu un mode, le mode de l’irréel,  le « conditionnel ». Et non l’inverse.

Pour la cohérence du récit, apparemment globalement au passé simple, on peut penser normal de conjuguer tous les verbes principaux au même temps :
— Il arriva. Je me tus. Il parla. J’écoutai. Il m’indiqua ceci. Je l’informai de cela.
C’est seulement là que se trouve l’incohérence dans le texte que vous présentez.

D’ailleurs la construction « je l’informais » est vouée à rester rare. Comment justifier l’imparfait ? Par la répétition (je l’informais souvent) ? Par la durée, (je l’informais depuis longtemps) ? Est-ce que ces sens correspondent bien au fait de donner une information à quelqu’un ? Est-ce qu’une information répétée reste une information ? Peut-on informer quelqu’un deux fois d’une même chose ? Peut-on informer sur la durée ? Tout cela est sans doute possible en théorie, mais pas dans votre phrase, car ici une personne informe clairement une unique fois d’une chose une autre personne.

Si vous acceptez le passé simple pour le verbe de la principale, il vous suffit d’appliquer la concordance des temps. Vous savez déjà que le conditionnel présent est utilisé pour exprimer le futur dans le passé (j’ai lu vos derniers posts qui montrent que vous parlez parfaitement le français) :
— Je sais qu’il viendra (futur dans le présent). Je savais qu’il viendrait (futur dans le passé).

Présent + construction déictique :
— Je l’informe que je pourrai être dans ses bureaux dans moins d’une heure.
Passé + concordance des temps + construction anaphorique :
— Je l’informai que je pourrais être dans ses bureaux moins d’une heure plus tard.