Nous donnerons l’argent aux associations que vous avez choisi de soutenir.
Le COD du verbe « choisir » n’est pas association mais le fait de les soutenir. Il n’y a donc pas accord avec « associations ».

Le PP suivi d’un infinitif s’accorde avec le COD qui précède lorsque l’être (ou la   chose) désigné par celui-ci fait l’action exprimée par l’infinitif, que celui-ci soit précédé ou non par une préposition.

Ex. : Les violonistes que j’ai entendus jouer étaient de jeunes élèves de l’Académie. Les airs que j’ai entendu jouer provenaient des opéras de Mozart.