Le singulier indique la matière : de la pomme de la tomate.
Le pluriel dénombre. En général quand on dit un kilo de, on dénombre et/ou on caractérise : dix kilos de belles tomates / de tomates noires de Crimée – un kilo de bonbons.
On écrira: un jus de pommes normandes/des pommes de notre verger.
Mais on aura  un kilo de farine, un kilo de sable parce que la farine et le sable ne se dénombrent pas.

—> Si vous écrivez un kilo de tomate, il s’agit de sauce tomate.