« Il croquait le petit fruit rouge et se voyait quarante ans auparavant… Peu importait que le fruit en question fût immangeable ».

Bonjour Bodrova.

Peu importe est suivi d’un fait supposé mais non encore réalisé. Cela implique le subjonctif.
Selon les règles de la concordance des temps, l’action de la principale se situant dans le passé, on utilisera le subjonctif présent ou imparfait : soit ou fût avec un accent circonflexe.

Alors, peu importe ou peu importait ?