Bonjour Jacques,
Si vous considérez que les oiseaux et les fleurs ont chacun plusieurs « comportements », vous écrirez « leur » au pluriel, comme d’ailleurs vous l’avez fait pour « habitudes ».
Mais l’on parle généralement du comportement des êtres humains ou des animaux et j’aurais utilisé le singulier : les oiseaux et les fleurs ont changé leur comportement et leurs habitudes.