La plus dure que son bourreau lui ait jamais infligée.
Oui, c’est juste. Après « le plus .. que » on a souvent un subjonctif.
Ceci parce qu’on fait un choix parmi des possibles. Le subjonctif  souligne le processus de la pensée qui évoque ces possibles.
Pour le plus que parfait  : quand Simon a commencé à exister, Tommy avait douze ans. Il s’était matérialisé
Il est parfaitement correct de l’utiliser puisque le plus que parfait exprime l’antériorité dans une phrase au passé. c’est bien le cas ici, le fait de se matérialiser ayant eu lieu avant  (même un millième de seconde avant) le fait d’exister et la phrase étant au passé (« a commencé », »avait »).

Contente de n’avoir pas fait de fautes. J’y suis allée à l’instinct 😉 Merci !