Bonsoir Minouche, d’un point de vue strictement grammatical, après que doit être suivi de l’indicatif (comme quand ou dès que). La phrase correcte est donc après que les autorités lui ont retiré leur protection. Cependant, l’usage a pendant assez longtemps (quelques décennies) consacré l’usage du subjonctif (sans doute par analogie avec avant que qui, lui, réclame le subjonctif), au point que la tournure avec l’indicatif a fini par sonner de façon très inhabituelle, voire fausse, à l’oreille. La forme la plus couramment entendue était après que les autorités lui aient retiré leur protection (qui sonne effectivement de façon beaucoup plus naturelle). Ce n’est que depuis quelques années qu’on assiste à un retour de l’indicatif, plus orthodoxe, mais qui malgré tout rend toujours à l’oreille de nombreuses personnes (à commencer par la mienne 😉 ) un effet un peu « forcé » et artificiel.

Dans l’idée, puisqu’on se situe après le fait, c’est qu’il est réalisé et il n’y a donc pas lieu d’utiliser du subjonctif ;
contrairement à « avant que » pour lequel le fait n’est pas encore réalisé et donc avec lequel le subjonctif prend tout son sens.

Bonjour Minouche,

Essayez de vous souvenir de cela : pas de subjonctif après après que.

Tout à fait, Pascool !

L’Académie continue de condamner l’emploi du subjonctif après après que : 

Petite astuce pour vous souvenir de la règle : le P de aPrès
Pas de subjonctif avec « après que »